X-men Destiny é baseado em uma das equipes de maior sucesso da Marvel Comics os X-men, aqui o jogador tem o contato com diversos personagens famosos das histórias em quadrinhos, interagindo com os mutantes para conseguir acabar com os vilões, nas versões de console o jogador tem a oportunidade de escolher dentre três mutantes jogáveis.
Aimi Yoshida, Grant Alexander e Adrian Luca são os três personagens que o jogador pode escolher, o escolhido vai lutar pela sobrevivência dentro do conflito de purificadores, tendo a possibilidade de escolher lutar ao lado dos X-men ou da Irmandade dos mutantes fazendo certas escolhas conforme a trama acontece.
