Deus Ex Human Revolution conta a história de um ataque à divisão de pesquisas da corporação na qual Adam trabalha, apesar das informações de como e, de quem realizou o ataque e por qual motivo não serem reveladas de maneira rápida, novas questões ainda mais intrigantes surgem com esta resposta.
O jogo traz uma relevância muito grande as decisões do jogador, cada decisão sua afetará o futuro do trama. Tais características evidenciam-se pelo fato de que a dificuldade dos chefões do jogo será calculada através de suas ações. Da mesma forma, suas decisões influenciam o modo como outros personagens o tratarão no jogo.
